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欧洲分子基因诊断质量联盟(EMQN)发布关于肌营养不良基因检测的最佳实践指南
肌营养不良(Dystrophinopathies)主要包括DMD基因致病变异导致的X连锁遗传的杜氏肌营养不良(Duchenne Muscular Dystrophy,DMD)和贝氏肌营养不良(Becker Muscular Dystrophy,BMD)。近年来,新的基因检测技术的应用和个性化药物的可行性影响了肌营养不良的诊断。2020年,EMQN为首的专家组对2010年发布的DMD/BMD分子诊断指南进行了更新,制定了肌营养不良症基因检测最佳实践指南。
[2010年发布]DMD基因分子诊断指南流程
流程更新
更新后DMD基因分子诊断指南流程
新技术(特别是下一代测序及RNA分析)在诊断中的应用和新的个体化药物的可行性,促进了2010版指南的更新。
DMD基因的致病性变异,大约有78%的致病性变异是由CNV(≥1个外显子的缺失或重复)引起,约22%是由SNV引起(图1):
图1
01.DMD基因检测技术
根据新的检测流程,推荐的DMD基因检测技术:
一级检测
CNV的重复与缺失的检测
注:以上三种技术均无法检测拷贝数重复的方向和位置
二级检测
SNV的检测
三级检测
RNA分析(对复杂的重排或深度内含子变异导致转录本中的伪外显子插入或隐蔽剪接位点识别)
02.DMD基因检测策略
诊断
携带者筛查
产前诊断
DMD/BMD/XLDC(X连锁扩张型心肌病)或任何与临床相关的肌营养不良的检测应仅限于男性胎儿。
03.变异的注释和解释
根据ACMG致病性判读指南:
04.报告解读
诊断报告
筛查报告
产前诊断
作为无DMD/BMD相关表型的偶然发现
该指南总结了目前推荐的检测DMD基因的技术和方法,包括检测一个或多个外显子的缺失和重复,小变异检测和RNA分析。然后概述了用于诊断、携带者检测和产前诊断的基因检测策略。并提供了DMD基因变异的注释和解释,其次是所有检测结果的报告和建议。为临床和实验室对肌营养不良的检测和报告提供了规范。
参考文献:
1. Eur J Hum Genet. 2020 Sep;28(9):1141-1159.[PMID:32424326]